气象场和化学物质排放是大气化学模式的两项最重要的前驱资料。在实验之余，我将着力学习WRF-Chem的有关内容，并记录、发布。
按照WRF-Chem Tutorial中的说明，在Learning to Run WRF-Chem之前，我先学习How to Generate Emission for WRF-Chem
本文记录Exercise 1的实现过程，可供有兴趣的同学参考。
WRF安装札记
实验室的服务器的四块硬盘全坏，而未进行备份，不得不将以前的内容全部重装一次。Python部分有Anaconda的分发包，比较容易。但常用的WRF模型却研究了好久。
之前，服务器采用的是ifort编译器。重装后，系统中只有gcc, 版本也比较旧(4.1.2)。 WRF编译失败，我认为原因可能是gcc太旧了。 因而，我考虑升级gcc的版本，同时由于本人不是root用户，也不能借助yum install gcc的简单办法，只得step by step地做。
本文记录了自gcc升级至WRF-Chem成功安装的全部流程，作为今后类似工作的参考。
翻译计划: 大气化学电子教材-第一章PartA
前沿
大气化学是一门关于大气中化学物质的排放、相互作用、物理及化学转化的综合性学科。同时，其对大气关键的物理过程亦会涉及。本计划所翻译的电子课本对大气化学领域近年来的研究进展(该课本编撰于2013年)进行陈述，如数学模型的并行计算研究，空气污染物对全球气候变化的影响等。原著作者期望本书的内容将为本科生与硕士生提供帮助，以之为专业课程的基础性参考资料。
第一章 大气层的结构和组成
大气层的总质量接近5.3x1018kg，而地球水圈(包括海洋、湖泊、河流、地下水以及冰雪)的总质量为1.4x1021kg，岩石圈总质量则为5.98x1024kg。大气层的上边界没有严格的定义。大气层中的物质随高度的上升而急剧减少，并最终融入星际空间之中。包含着大量气体及颗粒组分的大气圈层围绕在地球的外部，随地球一同绕日旋转。
地球大气层的密度分布极不均匀。距离地面5.5 Km以下的空气占据着大气层一半的质量，而大气层约99%的质量分布在距地30 Km以内。地球大气层的范围和地球磁气圈的范围一致(图1.1)，这一形态由地球本体磁场与太阳风[1]的相互作用而最终形成。
安装笔记: 在Jupyter中添加R Kernel
Jupyter(即原来的Ipython Notebook Project)基于Web端的实时交互，拥有着极佳的用户体验。同时，Jupyter体系可直接使用其他语言，用户呢能够在同一界面下调用R内核或Python内核(共支持49种)，功能十分强大。
在Mac OS下尝试在Jupyter中添加R语言内核，遇到了一些问题，在此记录个人安装过程和诸问题的解决方法。
STEP1 基本软件准备
- Python和IPython.作为初学者，我直接安装了Python的科学计算发行版Anaconda，其包含了Python2.7并内置很多有用的Package(numpy, SciPy, Matplotlib)，Jupyter(Ipython Notebook)以及Spyder(个人感觉类似于R studio的集成开发环境)
- R 3.2.1(World-Famous Astronaut)，官网下载安装即可。
STEP2 有关库的安装
主要工作是为R语言添加IRkernal这一新的Package, 以实现Jupyter对R语言的支持。主要的步骤如下(依照IRkernal的README文档)：