#Linux

在国外新购置了一台PC,性能比从国内带来的Mac笔记本要好,也可以继续玩Steam上的游戏。决定将个人学习工作环境迁移至Windows系统。在此记录相关配置步骤,以便未来之需。

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以前处理WRF等气象模型的输出文件,总是下载到本地电脑做后处理分析。由于计算量不断增加,模拟生成的文件往往会很大。因而,我考虑直接在服务器中处理数据。本来是很容易的事情,却因为课题组服务器的系统版本较旧,在安装有关工具时耗去了不少时间。在此记录我的探索过程。

气象模拟文件的后处理PartA: 曲折的安装

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FLEXPART is a Lagrangian particle dispersion model (LPDM) developed by Norwegian Institute of Air Research, Norway. It allows researchers to simulate the long-range transportation, diffusion, dry/wet deposition processes of atmospheric spcecies from their sources. It also can be utilized for backward calculation based on the observation of receptor to anaysis source-receptor relationships.

This model is coded following the Fortran 95 standard, and can be freely download from the page here. Flexpart 8.x/9.x is easy for compilation following the offical reference. I noticed that netCDF-format output (which would make the post-processing easier compared to the original binary output files) has been merged in the newer veision. Therefore, I tried to compile FLEXPART 10.0 beta version in the Linux system, while lots of issues appeared. My installing steps are listed as follows

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本文是我学习官网练习的记录,其模拟区域为北非,中东以及欧洲部分地区,无嵌套设置。共分为5个练习,分别为:

  1. 初始场添加沙尘排放源的模拟
  2. 采用GOCART全球气溶胶排放清单的模拟
  3. 加入生物源排放的化学模拟(MEGAN引入)
  4. 加入气溶胶直接/间接辐射效应的模拟
  5. WRF-Chem数值预报实验

下文记录Exercise 1的流程和注意事项

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实验室的服务器的四块硬盘全坏,而未进行备份,不得不将以前的内容全部重装一次。Python部分有Anaconda的分发包,比较容易。但常用的WRF模型却研究了好久。

之前,服务器采用的是ifort编译器。重装后,系统中只有gcc, 版本也比较旧(4.1.2)。 WRF编译失败,我认为原因可能是gcc太旧了。 因而,我考虑升级gcc的版本,同时由于本人不是root用户,也不能借助yum install gcc的简单办法,只得step by step地做。

本文记录了自gcc升级至WRF-Chem成功安装的全部流程,作为今后类似工作的参考。

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